导读：柚子猫 足交

Nature同款、高颜值富集分析成果条形图，将富集名字标注在条形上，并在条形的底下添加一转基因名。既能省俭空间，又能展示更多维度的信息。

Nature著作《CHIT1-positive microglia drive motor neuron ageing in the primate spinal cord》中的富集成果条形图。该图展示了猴脊髓单核测序成果中，小胶质细胞2（microglia 2）和小胶质细胞3（microglia 3）的top50 marker基因的GO富集分析成果。X轴暗示-log10(p)，Y轴暗示富集条件，蓝色暗示小胶质细胞2的富集成果，红色暗示小胶质细胞3的富集成果。条形的长度对应-log10(p)。此图改换性地在条形的底下展示了每个条件中包含的基因。神色，布局，创意等，齐值得咱们学习和鉴戒。

用粗陋的图，直不雅地展示成果，让读者一眼就能看出作家要抒发的深嗜，通衢至简。

1，掀开作图URL

https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_go_kegg_enrichment_hbar_with_genes_250

2，示例数据

点击图片上方的示例数据，下载，并使用excel掀开。

示例数据是惯例的富集分析成果，包括4列：

第1列：分组，暗示富集成果的开始。举例BP/CC/MF/KEGG，大概不同的比拟，不同的细胞群等

第2列：term名。若是名字过长，会影响图片好意思不雅度，此时提出简写大概缩写

第3列：pvalue柚子猫 足交，大概FDR，p.adj等，弗成为0

第4列：/分割的基因。成果图中替换成了逗号分割

3，输入查验

扎眼：输入数据应当左证第1列分组，分块按照p值从小到大排序后，再作图。举例BP的放一块，CC的放一块。不要BP中间插个CC。

示例数据：点击输入框底下的“示例”按钮，将载入示例数据。

真确数据：数据放在excel中，转机好后，Ctrl+A选中数据，Ctrl+C拷贝，Ctrl+V粘贴数据到输入框中。

然后使用输入框底下的“输入查验”按钮先对输入数据进行查验。若查验欠亨过，请左证查验领导重复【修改-输入查验】面貌，直到查验通过（如下图所示），然后不错不息聘请参数。

注：输入查验是新加功能，它会左证不同模块的输入要求，逐行逐列查验输入数据，并给出领导，确保数据恰当模块要求。

4，聘请参数

图片大小：图片宽度，图片高度

条形高度：水平神色条的高度

X轴刻度字体大小：收尾X轴上数字刻度的字体

轴透露翰墨字体大小：收尾X轴-log10(p)和Y轴不同分组的字体

Term翰墨字体大小：收尾神色条上标注的Term的翰墨字体

条形下方基因字体大小：收尾条形底下基因名的字体，默许为斜体

神色：拓荒了6种神色（最多不错绘制6组富集成果），按照数据中第一列的章程指定神色。神色遮盖了条形的神色，基因名的神色，以及Y轴组名的神色。

是否在条形下方添加基因选项：聘请添加则如例图所示，聘请不添加则仅清晰条形，不清晰基因名。

字体：拓荒了期刊杂志中最常用的两种：Times New Roman和Arial。如需使用其他字体，不错使用acrobat illustrator剪辑生成的pdf大概svg图片

5，提交出图

查验通过，况兼参数选好后，点击“提交”按钮，约3s后，会在页面上呈现富集成果图片。咱们提供了pdf、svg两种矢量图，png、tiff两种标量图供大家下载使用。不错使用acrobat illustrator等软件剪辑矢量图，进行组图，转机字体等操作，以粗糙论文要求。

不带基因名的示举例下

领导：在骨子绘制中，需要左证富集条野心若干，转机图片的高度，条形的高度，以及term翰墨字体大小，基因名字体大小等，幸免基因名和条形肖似、挤压，以赢得愈加无缺的成果图片。

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